Mus musculus Gene: Dclre1c | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-133199.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dclre1c | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA cross-link repair 1C, PSO2 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026648 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DNA cross-link repair 1C, PSO2 homolog (S. cerevisiae)
DNA cross-link repair 1C, PSO2 homolog (S. cerevisiae)
DNA cross-link repair 1C, PSO2 homolog (S. cerevisiae)
DNA cross-link repair 1C, PSO2 homolog (S. cerevisiae)
DNA cross-link repair 1C, PSO2 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000152457:
This gene encodes a nuclear protein that is involved in V(D)J recombination and DNA repair. The protein has single-strand-specific 5'-3' exonuclease activity; it also exhibits endonuclease activity on 5' and 3' overhangs and hairpins when complexed with protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide. Mutations in this gene cause Athabascan-type severe combined immunodeficiency (SCIDA). [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:3424131-3464130 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
Primary immunodeficiency pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
Primary immunodeficiency pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
ATM pathway
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8K4J0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 227525 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.23483 Mm.442710 Mm.446503 Mm.446697 Mm.447773 Mm.447788 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_006497464 NM_001110214 NM_146114 NM_175683 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15649 CCDS15650 CCDS50486 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2441769 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Dclre1c | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF387731 AK037126 AK052369 AK088810 AL732620 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAM89119 BAC29713 BAC34960 BAC40586 CAM16038 CAM16039 CAM16040 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 227525 | ||||||||||||||||||||||