Mus musculus Gene: Ahr | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-134957.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ahr | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | aryl-hydrocarbon receptor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Ah; Ahh; Ahre; bHLHe76; In | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000019256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
aryl-hydrocarbon receptor
aryl-hydrocarbon receptor
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Ahr deficiency impairs TLR and NFkB-mediated proinflammatory gene expression after activation by a classical stimulus, such as LPS.
Innate expression of Ahr plays a protective role in T-cell-induced colitis by suppressing T helper 17 cells, thus inhibiting proinflammatory cytokine production.
Uropathogenic Escherichia coli suppresses neutrophil migration early in bacterial cystitis by eliciting an Ido1-mediated increase in local production of kynurenines, which act through the Ahr to impair neutrophil chemotaxis.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] AHR deficiency imapirs TLR and NFkB-mediated proinflammatory gene expression after activation by a classical stimulus, such as LPS. (Demonstrated in murine model)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000106546:
This gene encodes a ligand-activated transcription factor involved in the regulation of biological responses to planar aromatic hydrocarbons. This receptor has been shown to regulate xenobiotic-metabolizing enzymes such as cytochrome P450. Its ligands included a variety of aromatic hydrocarbons. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:35497974-35535038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 41 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.341377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_013464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||