Mus musculus Gene: Chdh | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-142274.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Chdh | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | choline dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000015970 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
choline dehydrogenase
choline dehydrogenase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000016391:
The protein encoded by this gene is a choline dehydrogenase that localizes to the mitochondrion. Variations in this gene can affect susceptibility to choline deficiency. A few transcript variants have been found for this gene, but the full-length nature of only one has been characterized to date. [provided by RefSeq, Dec 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:30009023-30040466 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Glycine, serine and threonine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Glycine, serine and threonine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8BJ64 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 218865 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.259916 Mm.402200 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001136240 NM_172264 NM_175343 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26892 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1860776 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Chdh | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK030900 AK164042 BC039186 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH39186 BAC27176 BAE37601 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 218865 | ||||||||||||||||||||||