Mus musculus Gene: Trim54 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-147658.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trim54 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif-containing 54 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4930486E09Rik; 4930566I02Rik; MURF; MURF-3; MuRF3; Rnf30 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000062077 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif-containing 54
tripartite motif-containing 54
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000138100:
The protein encoded by this gene contains a RING finger motif and is highly similar to the ring finger proteins RNF28/MURF1 and RNF29/MURF2. In vitro studies demonstrated that this protein, RNF28, and RNF29 form heterodimers, which may be important for the regulation of titin kinase and microtubule-dependent signal pathways in striated muscles. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:31116712-31137630 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 27 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9QAT9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 58522 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.143796 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021447 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19173 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1889623 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Trim54 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC109608 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 58522 | ||||||||||||||||||||||