Mus musculus Gene: Tcof1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-150420.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tcof1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Treacher Collins Franceschetti syndrome 1, homolog | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA408847; AW209012; treacle | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024613 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Treacher Collins Franceschetti syndrome 1, homolog
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000070814:
This gene encodes a nucleolar protein with a LIS1 homology domain. The protein is involved in ribosomal DNA gene transcription through its interaction with upstream binding factor (UBF). Mutations in this gene have been associated with Treacher Collins syndrome, a disorder which includes abnormal craniofacial development. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:60813755-60848971 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 29 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.443372 Mm.446728 Mm.486251 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001198984 NM_011552 XM_006525777 XM_006525779 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37836 CCDS57125 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||