Mus musculus Gene: Syk | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-152695.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Syk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | spleen tyrosine kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Sykb | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
spleen tyrosine kinase
spleen tyrosine kinase
spleen tyrosine kinase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Sykb promotes wound healing in human rhinovirus-infected airway epithelial cells. (Demonstrated in human)
SYK is a tyrosine protein kinase that is an upstream activator of c-Jun N-terminal kinase (JNK).
SYK interacts with PLCG2 and plays a role in complement mediated phagocytosis by regulating both actin dynamics and the RhoA activation pathway.
SYK interacts with TRAF-interacting protein (TIRAP), two proteins with opposing effects on tumour necrosis factor (TNF) signalling where SYK enhances the activation of NF-kappaB by TNF and this is antagonized by TIRAP.
SYK operating downstream of ITAM-coupled fungal pattern recognition receptors by controlling both pro-IL-1beta synthesis and inflammasome activation after fungal infection.
SYK and MYD88 adaptor protein pathways activation by bacteria promotes regulatory properties of neutrophils.
SYK is activated by several ITAM-containing or ITAM-coupled C-type lectin receptors on myeloid cells leading to the production of pro-inflammatory cytokines including IL-1-beta to initiate antifungal responses.
SYK promotes wound healing in human rhinovirus-infected airway epithelial cells.
Phosphorylation of the inflammasome adaptor Pycard (ASC) controls inflammasome activity through the formation of ASC specks. The NLRP3 and AIM2 inflammasomes require Syk and Mapk8 (JNK) for their full activity .
The expression of Clec4e (Mincle) and its downstream signal phospho-Syk/Syk increases after cerebral ischemia and reperfusion.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Antibody-dependent enhancement (ADE) of Dengue virus serotype 2 (DENV-2) elevates mature IL1B secretion via SYK signalling pathway in primary monocytes.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000165025:
This gene encodes a member of the family of non-receptor type Tyr protein kinases. This protein is widely expressed in hematopoietic cells and is involved in coupling activated immunoreceptors to downstream signaling events that mediate diverse cellular responses, including proliferation, differentiation, and phagocytosis. It is thought to be a modulator of epithelial cell growth and a potential tumour suppressor in human breast carcinomas. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:52583173-52648792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 50 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 102 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers pathway
Hemostasis pathway
Interleukin-2 signaling pathway
Role of phospholipids in phagocytosis pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
FCGR activation pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
FCERI mediated Ca+2 mobilization pathway
Signaling by Interleukins pathway
Fcgamma receptor (FCGR) dependent phagocytosis pathway
Adaptive Immune System pathway
Signal Transduction pathway
Integrin alphaIIb beta3 signaling pathway
Platelet Aggregation (Plug Formation) pathway
FCERI mediated MAPK activation pathway
DAP12 interactions pathway
DAP12 signaling pathway
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KEGG |
Fc epsilon RI signaling pathway pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
B cell receptor signaling pathway pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Osteoclast differentiation pathway
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INOH |
IL-7 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
B cell receptor signaling pathway
EPO signaling pathway pathway
VEGF signaling pathway pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
TCR pathway
BCR pathway
IL2 pathway
IL3 pathway
IL4 pathway
IL5 pathway
RANKL pathway
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REACTOME |
DAP12 signaling pathway
DAP12 interactions pathway
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation pathway
Role of phospholipids in phagocytosis pathway
FCGR activation pathway
Regulation of signaling by CBL pathway
Interleukin-3, 5 and GM-CSF signaling pathway
Interleukin-2 signaling pathway
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers pathway
Integrin alphaIIb beta3 signaling pathway
Platelet Aggregation (Plug Formation) pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
Signal Transduction pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
Fcgamma receptor (FCGR) dependent phagocytosis pathway
FCERI mediated Ca+2 mobilization pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
FCERI mediated MAPK activation pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Fc epsilon RI signaling pathway pathway
B cell receptor signaling pathway pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Osteoclast differentiation pathway
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INOH |
IL-7 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
B cell receptor signaling pathway
EPO signaling pathway pathway
VEGF signaling pathway pathway
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PID NCI |
Atypical NF-kappaB pathway
Alpha-synuclein signaling
Thromboxane A2 receptor signaling
IL2-mediated signaling events
BCR signaling pathway
GMCSF-mediated signaling events
Fc-epsilon receptor I signaling in mast cells
Osteopontin-mediated events
FAS (CD95) signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PWE9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.375031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001198977 NM_011518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26517 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:99515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Syk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC159192 AC160765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||