Mus musculus Gene: Muc20 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-154788.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Muc20 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | mucin 20 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000035638 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
mucin 20
mucin 20
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000176945:
This gene encodes a member of the mucin protein family. Mucins are high molecular weight glycoproteins secreted by many epithelial tissues to form an insoluble mucous barrier. The shorter isoform expressed by this gene is localized to the plasma membrane, whereas the longer isoform might be secreted. The C terminus of this protein associates with the multifunctional docking site of the met proto-oncogene and suppresses activation of some downstream met signaling cascades. The protein features a tandem repeat domain that varies between 2 and 6 copies in most individuals. The allele represented in the human reference assembly contains 12 copies. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:32777419-32797435 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
O-linked glycosylation of mucins pathway
Termination of O-glycan biosynthesis pathway
Metabolism of proteins pathway
Post-translational protein modification pathway
O-linked glycosylation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Termination of O-glycan biosynthesis pathway
O-linked glycosylation of mucins pathway
Post-translational protein modification pathway
O-linked glycosylation pathway
Metabolism of proteins pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by Hepatocyte Growth Factor Receptor (c-Met)
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8BUE7 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 224116 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.153301 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_146071 NM_001145874 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49830 CCDS49829 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2385039 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Muc20 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AB098732 AK085640 AK165477 BC026367 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH26367 BAC39492 BAD06719 BAE38212 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 224116 | ||||||||||||||||||||||