Mus musculus Gene: Pvrl1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155297.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pvrl1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | poliovirus receptor-related 1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI835281; AW549174; Cd111; HIgR; HveC; nectin-1; PRR; PRR1 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032012 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
poliovirus receptor-related 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000110400:
This gene encodes an adhesion protein that plays a role in the organization of adherens junctions and tight junctions in epithelial and endothelial cells. The protein is a calcium(2+)-independent cell-cell adhesion molecule that belongs to the immunoglobulin superfamily and has 3 extracellular immunoglobulin-like loops, a single transmembrane domain (in some isoforms), and a cytoplasmic region. This protein acts as a receptor for glycoprotein D (gD) of herpes simplex viruses 1 and 2 (HSV-1, HSV-2), and pseudorabies virus (PRV) and mediates viral entry into epithelial and neuronal cells. Mutations in this gene cause cleft lip and palate/ectodermal dysplasia 1 syndrome (CLPED1) as well as non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (CL/P). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding proteins with distinct C-termini. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:43744576-43807454 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | A5.1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell-cell junction organization pathway
Adherens junctions interactions pathway
Nectin/Necl trans heterodimerization pathway
Cell junction organization pathway
Cell-Cell communication pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Adherens junction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Nectin/Necl trans heterodimerization pathway
Adherens junctions interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Cell-cell junction organization pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Adherens junction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Nectin adhesion pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.335096 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021424 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23092 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||