Mus musculus Gene: Nr1i2 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-159925.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nr1i2 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | mPXR; PXR; PXR.1; PXR.2; PXR1; SXR | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022809 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000144852:
This gene product belongs to the nuclear receptor superfamily, members of which are transcription factors characterized by a ligand-binding domain and a DNA-binding domain. The encoded protein is a transcriptional regulator of the cytochrome P450 gene CYP3A4, binding to the response element of the CYP3A4 promoter as a heterodimer with the 9-cis retinoic acid receptor RXR. It is activated by a range of compounds that induce CYP3A4, including dexamethasone and rifampicin. Several alternatively spliced transcripts encoding different isoforms, some of which use non-AUG (CUG) translation initiation codon, have been described for this gene. Additional transcript variants exist, however, they have not been fully characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:38248323-38294824 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | B3 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 31 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Gene Expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.8509 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001098404 NM_010936 XM_006521846 XM_006521848 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28164 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||