Mus musculus Gene: Vps72 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-171412.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vps72 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 72 (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Tcfl1; YL-1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000008958 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 72 (yeast)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000163159:
The protein encoded by this gene is a shared subunit of two multi-component complexes, the histone acetyltransferase complex TRRAP/TIP60 as well as the chromatin remodeling SRCAP-containing complex. The TRRAP/TIP60 complex acetylates nucleosomal histones important for transcriptional regulation, double strand DNA break repair and apoptosis. The SRCAP-containing complex catalyzes the exchange of histone H2A with the histone variant Htz1 (H2AFZ) into nucleosomes. This protein may be responsible for binding H2AFZ, which has a role in chromosome segregation. This protein may also have a role in regulating long-term hematopoietic stem cell activity. Alternative splicing results in multiple transcript variants that encode different protein isoforms. [provided by RefSeq, Aug 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:95111022-95123051 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F2.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 25 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
HATs acetylate histones pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HATs acetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Chromatin organization pathway
HATs acetylate histones pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.133919 Mm.467327 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009336 XM_006501291 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38543 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||