Mus musculus Gene: Synj1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-175516.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Synj1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | synaptojanin 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | A930006D20Rik; AA675315; mKIAA0910 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022973 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000159082:
This gene encodes a phosphoinositide phosphatase that regulates levels of membrane phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate. As such, expression of this enzyme may affect synaptic transmission and membrane trafficking. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:90936092-91011308 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Phosphatidylinositol signaling system pathway
Inositol phosphate metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of PIPs at the plasma membrane pathway
Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol pathway
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
PI Metabolism pathway
Phospholipid metabolism pathway
Inositol phosphate metabolism pathway
Metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Inositol phosphate metabolism pathway
Phosphatidylinositol signaling system pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH |
Inositol phosphate metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Internalization of ErbB1
EPHB forward signaling
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.187079 Mm.396726 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001045515 NM_001164483 XM_006522835 XM_006522842 XM_006522846 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49906 CCDS49907 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||