Bos taurus Gene: BT.103203 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-629873.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.103203 | ||||||||||||||||||
Gene Name | synaptojanin-1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000003063 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
synaptojanin-1
synaptojanin-1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000159082:
This gene encodes a phosphoinositide phosphatase that regulates levels of membrane phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate. As such, expression of this enzyme may affect synaptic transmission and membrane trafficking. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:2109219-2196114 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 20 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of PIPs at the plasma membrane pathway
Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol pathway
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
PI Metabolism pathway
Phospholipid metabolism pathway
Inositol phosphate metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Inositol phosphate metabolism pathway
Phosphatidylinositol signaling system pathway
Phosphatidylinositol signaling system pathway
Inositol phosphate metabolism pathway
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INOH |
Inositol phosphate metabolism pathway
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PID NCI |
Internalization of ErbB1
EPHB forward signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MC12 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 282087 | ||||||||||||||||||
UniGene | Bt.103203 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174468 XM_005201089 XM_005201090 XM_005201095 XM_005201096 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11503 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02000041 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 282087 | ||||||||||||||||||