Mus musculus Gene: Trpc5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-177241.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trpc5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CCE2; TRP-5; TRP5; Trrp5 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000041710 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000072315:
This gene belongs to the transient receptor family. It encodes one of the seven mammalian TRPC (transient receptor potential channel) proteins. The encoded protein is a multi-pass membrane protein and is thought to form a receptor-activated non-selective calcium permeant cation channel. The protein is active alone or as a heteromultimeric assembly with TRPC1, TRPC3, and TRPC4. It also interacts with multiple proteins including calmodulin, CABP1, enkurin, Na(+)-H+ exchange regulatory factor (NHERF ), interferon-induced GTP-binding protein (MX1), ring finger protein 24 (RNF24), and SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1 (SESTD1). [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:144381671-144688180 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Netrin-1 signaling pathway
Role of second messengers in netrin-1 signaling pathway
Ion channel transport pathway
Axon guidance pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Developmental Biology pathway
TRP channels pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Role of second messengers in netrin-1 signaling pathway
Netrin-1 signaling pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
Ion channel transport pathway
TRP channels pathway
TRP channels pathway
Ion channel transport pathway
Netrin-1 signaling pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Axon guidance pathway
Role of second messengers in netrin-1 signaling pathway
Stimuli-sensing channels pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.328378 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009428 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30457 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||