Mus musculus Gene: Srek1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179315.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Srek1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032621 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000153914:
This gene encodes a member of a family of serine/arginine-rich (SR) splicing proteins containing RNA recognition motif (RRM) domains. The encoded protein interacts with other SR proteins to modulate splice site selection. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:103741615-103764504 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 55 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8BZX4 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 218543 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.458176 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_172592 XM_006517607 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26743 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2145245 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Srek1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK033354 AK037115 AK039311 AK044086 AK052265 BC070460 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH70460 BAC28243 BAC29709 BAC30314 BAC31767 BAC34905 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 218543 | ||||||||||||||||||||||