Mus musculus Gene: Pnkp | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179919.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pnkp | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | polynucleotide kinase 3'- phosphatase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1810009G08Rik; PNK | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000002963 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
polynucleotide kinase 3'- phosphatase
polynucleotide kinase 3'- phosphatase
polynucleotide kinase 3'- phosphatase
polynucleotide kinase 3'- phosphatase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000039650:
This locus represents a gene involved in DNA repair. In response to ionizing radiation or oxidative damage, the protein encoded by this locus catalyzes 5' phosphorylation and 3' dephosphorylation of nucleic acids. Mutations at this locus have been associated with microcephaly, seizures, and developmental delay.[provided by RefSeq, Sep 2010] This locus represents a gene involved in DNA repair. In response to ionizing radiation or oxidative damage, the protein encoded by this locus catalyzes 5\' phosphorylation and 3\' dephosphorylation of nucleic acids. Mutations at this locus have been associated with microcephaly, seizures, and developmental delay.[provided by RefSeq, Sep 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:44857139-44862925 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 42 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YZV7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 59047 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.238254 Mm.431864 Mm.487968 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001290764 NM_001290766 NM_021549 XM_006541041 XM_006541042 XM_006541044 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS39945 CCDS71955 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1891698 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pnkp | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC158231 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 59047 | ||||||||||||||||||||||