Mus musculus Gene: Lrrfip1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-180425.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lrrfip1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AU024550; Fliiap1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026305 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] LRRFIP1 interacts with and activates beta-catenin, which increases IFN-beta expression by binding to the C-terminal domain of the transcription factor IRF3 and recruiting the acetyltransferase EP300 to the IFN-beta enhanceosome via IRF3.
[Homo sapiens] LRRFIP1 (GCF2) acts as a repressor and occupies the -308 site of the TNF-alpha promoter in cells that do not make TNF-alpha. Other proteins may bind to the promoter, particular to the -308 site to transition from repressed to active transcription.
[Homo sapiens] LRRFIP1 is a regulator of toll-like receptor (TLR) pathway signaling and it co-localized with dsRNA in monocyte lysosomal structures.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000124831:
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:90998737-91128944 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME |
Signaling by FGFR1 fusion mutants pathway
Signaling by FGFR mutants pathway
Signaling by FGFR in disease pathway
LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production pathway
Innate Immune System pathway
Signaling by FGFR1 mutants pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16978 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001111311 NM_001111312 NM_008515 XM_006529192 XM_006529208 XM_006529210 XM_006529212 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35662 CCDS48319 CCDS48320 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1342770 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lrrfip1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 16978 | ||||||||||||||||||||||