Homo sapiens Gene: LRRFIP1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-84322.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LRRFIP1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | FLAP-1; FLAP1; FLIIAP1; GCF-2; GCF2; HUFI-1; TRIP | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000124831 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
LRRFIP1 interacts with and activates beta-catenin, which increases IFN-beta expression by binding to the C-terminal domain of the transcription factor IRF3 and recruiting the acetyltransferase EP300 to the IFN-beta enhanceosome via IRF3.
LRRFIP1 (GCF2) acts as a repressor and occupies the -308 site of the TNF-alpha promoter in cells that do not make TNF-alpha. Other proteins may bind to the promoter, particular to the -308 site to transition from repressed to active transcription.
LRRFIP1 is a regulator of toll-like receptor (TLR) pathway signaling and it co-localized with dsRNA in monocyte lysosomal structures.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:237627576-237813682 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q37.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 29 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME |
Signaling by FGFR1 fusion mutants pathway
Signaling by FGFR mutants pathway
Signaling by FGFR in disease pathway
LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production pathway
Innate Immune System pathway
Signaling by FGFR1 mutants pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.638039 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001137550 NM_001137552 NM_001137553 NM_004735 XM_005246136 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2521 CCDS46551 CCDS46552 CCDS46553 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04460 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||