Mus musculus Gene: Cldn18 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-193115.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cldn18 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | claudin 18 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032473 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
claudin 18
claudin 18
claudin 18
claudin 18
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the claudin family. Claudins are integral membrane proteins and components of tight junction strands. Tight junction strands serve as a physical barrier to prevent solutes and water from passing freely through the paracellular space between epithelial or endothelial cell sheets, and also play critical roles in maintaining cell polarity and signal transductions. This gene is a downstream target gene regulated by the T/EBP/NKX2.1 homeodomain transcription factor. Four alternatively spliced transcript variants resulted from alternative promoters and alternative splicing have been identified, which encode two lung-specific isoforms and two stomach-specific isoforms respectively. This gene is also expressed in colons, inner ear and skin, and its expression is increased in both experimental colitis and ulcerative colitis. [provided by RefSeq, Aug 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:99689461-99717267 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E3.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Tight junction pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Tight junction interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Cell-cell junction organization pathway
Cell junction organization pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell-cell junction organization pathway
Tight junction interactions pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Tight junction pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.386501 Mm.386784 Mm.469796 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001194921 NM_001194922 NM_001194923 NM_019815 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23437 CCDS57692 CCDS57693 CCDS57694 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||