Mus musculus Gene: Shmt2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-195290.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Shmt2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2700043D08Rik; AA408223; AA986903 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025403 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000182199:
This gene encodes the mitochondrial form of a pyridoxal phosphate-dependent enzyme that catalyzes the reversible reaction of serine and tetrahydrofolate to glycine and 5,10-methylene tetrahydrofolate. The encoded product is primarily responsible for glycine synthesis. The activity of the encoded protein has been suggested to be the primary source of intracellular glycine. The gene which encodes the cytosolic form of this enzyme is located on chromosome 17. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:127517123-127522444 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Glycine, serine and threonine metabolism pathway
Cyanoamino acid metabolism pathway
One carbon pool by folate pathway
Glyoxylate and dicarboxylate metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
One carbon pool by folate pathway
Cyanoamino acid metabolism pathway
Glycine, serine and threonine metabolism pathway
Glyoxylate and dicarboxylate metabolism pathway
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INOH |
Folate metabolism pathway
Glycine Serine metabolism pathway
Lysine degradation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3TFD0 Q9CZN7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 108037 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29890 Mm.452389 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001252316 NM_028230 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24244 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1277989 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Shmt2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC167719 AK012355 AK037339 AK051207 AK162421 AK169192 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | BAB28184 BAC29790 BAC34556 BAE36907 BAE40968 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 108037 | ||||||||||||||||||||||