Mus musculus Gene: Vps29 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-198096.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vps29 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 29 (S. pombe) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2010015D08Rik; AW049835; PEP11 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029462 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 29 (S. pombe)
vacuolar protein sorting 29 (S. pombe)
vacuolar protein sorting 29 (S. pombe)
vacuolar protein sorting 29 (S. pombe)
vacuolar protein sorting 29 (S. pombe)
vacuolar protein sorting 29 (S. pombe)
vacuolar protein sorting 29 (S. pombe)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000111237:
This gene belongs to a group of vacuolar protein sorting (VPS) genes that, when functionally impaired, disrupt the efficient delivery of vacuolar hydrolases. The protein encoded by this gene is a component of a large multimeric complex, termed the retromer complex, which is involved in retrograde transport of proteins from endosomes to the trans-Golgi network. This VPS protein may be involved in the formation of the inner shell of the retromer coat for retrograde vesicles leaving the prevacuolar compartment. Alternative splice variants encoding different isoforms, and usage of multiple polyadenylation sites have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:122354369-122364984 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 18 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 27 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Disease pathway
Signaling by Wnt pathway
WNT ligand biogenesis and trafficking pathway
Signaling by WNT in cancer pathway
WNT ligand secretion is abrogated by the PORCN inhibitor LGK974 pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Signaling by WNT in cancer pathway
Signaling by Wnt pathway
WNT ligand secretion is abrogated by the PORCN inhibitor LGK974 pathway
Signal Transduction pathway
WNT ligand biogenesis and trafficking pathway
Disease pathway
Signaling by Wnt pathway
Signaling by WNT in cancer pathway
WNT ligand biogenesis and trafficking pathway
WNT ligand secretion is abrogated by the PORCN inhibitor LGK974 pathway
Signal Transduction pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.392651 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_019780 XM_006530427 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS39256 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||