Mus musculus Gene: Clip1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-199787.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Clip1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | CAP-GLY domain containing linker protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110007I12Rik; 4631429H07Rik; AV017631; C81039; CLIP-170; CLIP170; Clip50; CYLN1; mKIAA4046; restin; Rsn | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000049550 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000130779:
The protein encoded by this gene links endocytic vesicles to microtubules. This gene is highly expressed in Reed-Sternberg cells of Hodgkin disease. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:123577795-123684618 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 15 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell Cycle, Mitotic pathway
Separation of Sister Chromatids pathway
Resolution of Sister Chromatid Cohesion pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Mitotic Metaphase and Anaphase pathway
Mitotic Prometaphase pathway
Mitotic Anaphase pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Resolution of Sister Chromatid Cohesion pathway
Mitotic Prometaphase pathway
Separation of Sister Chromatids pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Mitotic Anaphase pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Mitotic Metaphase and Anaphase pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
mTOR signaling pathway
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z2Z1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56430 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.241109 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_006530422 NM_001291229 NM_019765 XM_006530407 XM_006530408 XM_006530409 XM_006530410 XM_006530411 XM_006530412 XM_006530413 XM_006530414 XM_006530415 XM_006530416 XM_006530417 XM_006530418 XM_006530419 XM_006530423 XM_006530424 XM_006530425 XM_006530426 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19667 CCDS71663 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1928401 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Clip1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC129569 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 56430 | ||||||||||||||||||||||