Homo sapiens Gene: XPC | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-19992.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | XPC | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | xeroderma pigmentosum, complementation group C | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | p125; RAD4; XP3; XPCC | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000154767 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
xeroderma pigmentosum, complementation group C
xeroderma pigmentosum, complementation group C
xeroderma pigmentosum, complementation group C
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a component of the nucleotide excision repair (NER) pathway. There are multiple components involved in the NER pathway, including Xeroderma pigmentosum (XP) A-G and V, Cockayne syndrome (CS) A and B, and trichothiodystrophy (TTD) group A, etc. This component, XPC, plays an important role in the early steps of global genome NER, especially in damage recognition, open complex formation, and repair protein complex formation. Mutations in this gene or some other NER components result in Xeroderma pigmentosum, a rare autosomal recessive disorder characterized by increased sensitivity to sunlight with the development of carcinomas at an early age. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:14145147-14178783 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p25.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 65 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
DNA Damage Recognition in GG-NER pathway
Dual incision reaction in GG-NER pathway
Formation of incision complex in GG-NER pathway
Global Genomic NER (GG-NER) pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D2CPJ8 E7EUB5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7508 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.475538 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001145769 NM_004628 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12816 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 613208 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS46763 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02046 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC093495 EU530528 FJ695191 FJ695192 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | ACE74251 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7508 | ||||||||||||||||||||||