Mus musculus Gene: Nphs2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-200232.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nphs2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | nephrosis 2 homolog, podocin (human) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026602 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nephrosis 2 homolog, podocin (human)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000116218:
This gene encodes the glomerular protein podocin which plays a role in the regulation of glomerular permeability, and acts as a linker between the plasma membrane and the cytoskeleton. Defects in this gene are the cause of autosomal recessive steroid-resistant nephrotic syndrome (SRN). SRN is characterized by onset between three months and five years, resistance to steroid therapy and rapid progression to end-stage renal disease. An alternative splice variant has been described but its full length sequence has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a protein that plays a role in the regulation of glomerular permeability. Mutations in this gene cause steroid-resistant nephrotic syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:156310727-156328035 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | G3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nephrin interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nephrin interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Nephrin/Neph1 signaling in the kidney podocyte
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q91X05 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C0LL75 C0LL94 C0LL99 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 170484 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.289099 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_130456 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15391 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2157018 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Nphs2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ302048 AK052746 AY050309 BC067401 FJ715751 FJ715757 FJ715758 FJ715770 FJ715775 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH67401 AAL06146 ACN67076 ACN67082 ACN67083 ACN67095 ACN67100 BAC35128 CAC44636 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 170484 | ||||||||||||||||||||||