Mus musculus Gene: Traf4 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-202221.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Traf4 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | TNF receptor associated factor 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | A530032M13Rik; CART1; msp2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000017386 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
TNF receptor associated factor 4
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000076604:
This gene encodes a member of the TNF receptor associated factor (TRAF) family. TRAF proteins are associated with, and mediate signal transduction from members of the TNF receptor superfamily. The encoded protein has been shown to interact with neurotrophin receptor, p75 (NTR/NTSR1), and negatively regulate NTR induced cell death and NF-kappa B activation. This protein has been found to bind to p47phox, a cytosolic regulatory factor included in a multi-protein complex known as NAD(P)H oxidase. This protein thus, is thought to be involved in the oxidative activation of MAPK8/JNK. Alternatively spliced transcript variants have been observed but the full-length nature of only one has been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:78158499-78165589 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B5 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 50 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Small cell lung cancer pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
|
||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Small cell lung cancer pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated transcriptional targets of TAp63 isoforms
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009423 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25090 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||