Mus musculus Gene: Sele | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-202283.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sele | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | selectin, endothelial cell | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD62E; E-selectin; Elam | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026582 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
selectin, endothelial cell
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] SELE is upregulated by TNF alpha during inflammatory responses and activated by RELA, NFKB2, JUN and ATF2.
|
||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000007908:
The protein encoded by this gene is found in cytokine-stimulated endothelial cells and is thought to be responsible for the accumulation of blood leukocytes at sites of inflammation by mediating the adhesion of cells to the vascular lining. It exhibits structural features such as the presence of lectin- and EGF-like domains followed by short consensus repeat (SCR) domains that contain 6 conserved cysteine residues. These proteins are part of the selectin family of cell adhesion molecules. Adhesion molecules participate in the interaction between leukocytes and the endothelium and appear to be involved in the pathogenesis of atherosclerosis. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:164048234-164057677 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | H2.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Hemostasis pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Malaria pathway
African trypanosomiasis pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Hemostasis pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Hemostasis pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Malaria pathway
African trypanosomiasis pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Thromboxane A2 receptor signaling
ATF-2 transcription factor network
Glucocorticoid receptor regulatory network
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q00690 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3U5F6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20339 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.5245 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011345 XM_006496715 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15432 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98278 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Sele | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC110499 AK153623 BC119083 BC120795 M80778 M87862 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA37547 AAA37577 AAI19084 AAI20796 BAE32123 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20339 | ||||||||||||||||||||||