Mus musculus Gene: Rnf135 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204021.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rnf135 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein 135 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610037N03Rik; 2410006N06Rik | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020707 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ring finger protein 135
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] RNF135 is essential for the association of DDX58 (RIG-I) and TRIM25, resulting in the activation of RIG-I signalling.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000181481:
The protein encoded by this gene contains a RING finger domain, a motif present in a variety of functionally distinct proteins and known to be involved in protein-protein and protein-DNA interactions. This gene is located in a chromosomal region known to be frequently deleted in patients with neurofibromatosis. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:80183851-80199757 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B5 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRAF6 mediated NF-kB activation pathway
Innate Immune System pathway
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
Immune System pathway
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10 pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
TRAF3-dependent IRF activation pathway pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
TRAF3-dependent IRF activation pathway pathway
TRAF6 mediated NF-kB activation pathway
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10 pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.22985 Mm.397785 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_028019 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25129 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||