Mus musculus Gene: Ctcfl | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-213356.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ctcfl | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | CCCTC-binding factor (zinc finger protein)-like | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000070495 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CCCTC-binding factor (zinc finger protein)-like
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000124092:
CCCTC-binding factor (CTCF), an 11-zinc-finger factor involved in gene regulation, utilizes different zinc fingers to bind varying DNA target sites. CTCF forms methylation-sensitive insulators that regulate X-chromosome inactivation. This gene is a paralog of CTCF and appears to be expressed primarily in the cytoplasm of spermatocytes, unlike CTCF which is expressed primarily in the nucleus of somatic cells. CTCF and the protein encoded by this gene are normally expressed in a mutually exclusive pattern that correlates with resetting of methylation marks during male germ cell differentiation. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:173093609-173119525 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | H3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.389396 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081387 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38349 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||