Homo sapiens Gene: SATB1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-21555.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SATB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SATB homeobox 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000182568 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
SATB homeobox 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a matrix protein which binds nuclear matrix and scaffold-associating DNAs through a unique nuclear architecture. The protein recruits chromatin-remodeling factors in order to regulate chromatin structure and gene expression. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2010] |
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:18345387-18445588 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p24.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 41 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Apoptosis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.517717 Hs.593276 Hs.629483 Hs.630427 Hs.674678 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001131010 NM_001195470 NM_002971 XM_006713280 XM_006713281 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2631 CCDS56242 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03647 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||