Mus musculus Gene: Satb1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-190608.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Satb1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | special AT-rich sequence binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610306G12Rik; AW413156 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000023927 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
special AT-rich sequence binding protein 1
special AT-rich sequence binding protein 1
special AT-rich sequence binding protein 1
special AT-rich sequence binding protein 1
special AT-rich sequence binding protein 1
special AT-rich sequence binding protein 1
special AT-rich sequence binding protein 1
special AT-rich sequence binding protein 1
special AT-rich sequence binding protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000182568:
This gene encodes a matrix protein which binds nuclear matrix and scaffold-associating DNAs through a unique nuclear architecture. The protein recruits chromatin-remodeling factors in order to regulate chromatin structure and gene expression. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:51736187-51833290 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | C | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptosis pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Apoptosis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q60611 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YU76 D3YZD1 D3Z4F8 D3Z7K4 E9Q535 F8WHG2 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20230 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.311655 Mm.396994 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001163632 NM_001163630 NM_001163631 NM_009122 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28876 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:105084 | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Satb1 | ||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC131975 AC154796 AK088563 AK158518 BC011132 CH466559 CT010371 U05252 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA17372 AAH11132 BAC40427 BAE34542 CAJ18578 EDL23652 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20230 | ||||||||||||||||||||||||