Homo sapiens Gene: TRIM23 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24045.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM23 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif containing 23 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ARD1; ARFD1; RNF46 | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000113595 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif containing 23
tripartite motif containing 23
tripartite motif containing 23
tripartite motif containing 23
tripartite motif containing 23
tripartite motif containing 23
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
TRIM23 mediates K(lys)-27-ubiquitin conjugation to IKBKG (NEMO) which is essential for TLR3- and RIG-I/MDA5-mediated antiviral innate and inflammatory responses.
TRIM23 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This protein is also a member of the ADP ribosylation factor family of guanine nucleotide-binding family of proteins. Its carboxy terminus contains an ADP-ribosylation factor domain and a guanine nucleotide binding site, while the amino terminus contains a GTPase activating protein domain which acts on the guanine nucleotide binding site. The protein localizes to lysosomes and the Golgi apparatus. It plays a role in the formation of intracellular transport vesicles, their movement from one compartment to another, and phopholipase D activation. Three alternatively spliced transcript variants for this gene have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:65589680-65625975 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | q12.3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 157 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RD22 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 373 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.792 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001656 NM_033227 NM_033228 XM_005248497 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:660 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601747 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3986 CCDS3987 CCDS43322 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03449 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC008560 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 373 | ||||||||||||||||||||||||||||