Homo sapiens Gene: PDCD6IP | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24373.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDCD6IP | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | programmed cell death 6 interacting protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AIP1; ALIX; DRIP4; HP95 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000170248 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
programmed cell death 6 interacting protein
programmed cell death 6 interacting protein
programmed cell death 6 interacting protein
programmed cell death 6 interacting protein
programmed cell death 6 interacting protein
programmed cell death 6 interacting protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that functions within the ESCRT pathway in the abscission stage of cytokinesis, in intralumenal endosomal vesicle formation, and in enveloped virus budding. Studies using mouse cells have shown that overexpression of this protein can block apoptosis. In addition, the product of this gene binds to the product of the PDCD6 gene, a protein required for apoptosis, in a calcium-dependent manner. This gene product also binds to endophilins, proteins that regulate membrane shape during endocytosis. Overexpression of this gene product and endophilins results in cytoplasmic vacuolization, which may be partly responsible for the protection against cell death. Several alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Related pseudogenes have been identified on chromosome 15. [provided by RefSeq, Jan 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:33798352-33869707 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p22.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 112 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Uptake and actions of bacterial toxins pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Budding and maturation of HIV virion pathway
Uptake and function of anthrax toxins pathway
Disease pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.475896 Hs.595926 Hs.611958 Hs.646405 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001162429 NM_013374 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2660 CCDS54561 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06425 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||