Homo sapiens Gene: CD2BP2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-26035.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CD2BP2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | CD2 (cytoplasmic tail) binding protein 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | FWP010; LIN1; PPP1R59; Snu40; U5-52K | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000169217 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CD2 (cytoplasmic tail) binding protein 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a bi-functional protein. In the cytoplasm, the encoded protein binds the cytoplasmic tail of human surface antigen CD2 via its C-terminal GYF domain, and regulate CD2-triggered T lymphocyte activation. In the nucleus, this protein is a component of the U5 small nuclear ribonucleoprotein complex and is involved in RNA splicing. A pseudogene has been identified on chromosome 7. Alternative splicing results in multiple transcript variants but their biological validity has not been determined. [provided by RefSeq, Nov 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:30350766-30355361 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p11.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 80 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.202677 Hs.737990 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001243646 NM_006110 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10675 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05127 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||