Homo sapiens Gene: ACAN | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-28773.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | ACAN | ||||||||||||||||||
Gene Name | aggrecan | ||||||||||||||||||
Synonyms | AGC1; AGCAN; CSPG1; CSPGCP; MSK16; SEDK | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000157766 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
aggrecan
aggrecan
aggrecan
aggrecan
aggrecan
aggrecan
aggrecan
aggrecan
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the aggrecan/versican proteoglycan family. The encoded protein is an integral part of the extracellular matrix in cartilagenous tissue and it withstands compression in cartilage. Mutations in this gene may be involved in skeletal dysplasia and spinal degeneration. Multiple alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms have been observed in this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:88803443-88875354 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q26.1 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH |
IL1 pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | E7ENV9 E7EX88 H0YM81 Q6LE94 Q6PID9 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 176 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.2159 Hs.616395 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001135 NM_013227 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:319 | ||||||||||||||||||
OMIM | 155760 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS53970 CCDS53971 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC103982 BC036445 L29488 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAB48068 AAH36445 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 176 | ||||||||||||||||||