Homo sapiens Gene: ACIN1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-3055.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ACIN1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | apoptotic chromatin condensation inducer 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ACINUS; ACN; fSAP152 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100813 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
apoptotic chromatin condensation inducer 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Apoptosis is defined by several morphologic nuclear changes, including chromatin condensation and nuclear fragmentation. This gene encodes a nuclear protein that induces apoptotic chromatin condensation after activation by caspase-3, without inducing DNA fragmentation. This protein has also been shown to be a component of a splicing-dependent multiprotein exon junction complex (EJC) that is deposited at splice junctions on mRNAs, as a consequence of pre-mRNA splicing. It may thus be involved in mRNA metabolism associated with splicing. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:23058564-23095614 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q11.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 93 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Apoptosis pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
RNA transport pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | S4R3H4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22985 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001164814 NM_001164815 NM_001164816 NM_001164817 NM_014977 XM_005267415 XM_005267416 XM_005267418 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17066 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 604562 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS53887 CCDS53888 CCDS53889 CCDS55905 CCDS9587 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL117258 AL132780 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 22985 | ||||||||||||||||||||||