Homo sapiens Gene: ATG10 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32027.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ATG10 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | autophagy related 10 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000152348 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ATG10 autophagy related 10 homolog (S. cerevisiae)
ATG10 autophagy related 10 homolog (S. cerevisiae)
ATG10 autophagy related 10 homolog (S. cerevisiae)
ATG10 autophagy related 10 homolog (S. cerevisiae)
ATG10 autophagy related 10 homolog (S. cerevisiae)
ATG10 autophagy related 10 homolog (S. cerevisiae)
ATG10 autophagy related 10 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Autophagy is a process for the bulk degradation of cytosolic compartments by lysosomes. ATG10 is an E2-like enzyme involved in 2 ubiquitin-like modifications essential for autophagosome formation: ATG12 (MIM 609608)-ATG5 (MIM 604261) conjugation and modification of a soluble form of MAP-LC3 (MAP1LC3A; MIM 601242), a homolog of yeast Apg8, to a membrane-bound form (Nemoto et al., 2003 [PubMed 12890687]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:81972025-82276857 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q14.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.658622 Hs.678105 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001131028 NM_031482 XM_005248610 XM_005248611 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4057 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16497 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||