Homo sapiens Gene: ARNTL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32620.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ARNTL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bHLHe5; BMAL1; BMAL1c; JAP3; MOP3; PASD3; TIC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000133794 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a basic helix-loop-helix protein that forms a heterodimer with CLOCK. This complex binds an E-box upstream of the PER1 gene, activating this gene and possibly other circadian rhythym-associated genes. Three transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is a basic helix-loop-helix protein that forms a heterodimer with CLOCK. This heterodimer binds E-box enhancer elements upstream of Period (PER1, PER2, PER3) and Cryptochrome (CRY1, CRY2) genes and activates transcription of these genes. PER and CRY proteins heterodimerize and repress their own transcription by interacting in a feedback loop with CLOCK/ARNTL complexes. Defects in this gene have been linked to infertility, problems with gluconeogenesis and lipogenesis, and altered sleep patterns. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:13276652-13387266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Circadian rhythm pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.65734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001030272 NM_001030273 NM_001178 NM_001297719 NM_001297722 NM_001297724 XM_005252928 XM_005252929 XM_005252930 XM_006718233 XM_006718234 XM_006718235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31430 CCDS44543 CCDS73259 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||