Homo sapiens Gene: HLA-DMB | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-403749.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HLA-DMB | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | major histocompatibility complex, class II, DM beta | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | D6S221E; RING7 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000242574 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
major histocompatibility complex, class II, DM beta
major histocompatibility complex, class II, DM beta
major histocompatibility complex, class II, DM beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
HLA-DMB belongs to the HLA class II beta chain paralogues. This class II molecule is a heterodimer consisting of an alpha (DMA) and a beta (DMB) chain, both anchored in the membrane. It is located in intracellular vesicles. DM plays a central role in the peptide loading of MHC class II molecules by helping to release the CLIP (class II-associated invariant chain peptide) molecule from the peptide binding site. Class II molecules are expressed in antigen presenting cells (APC: B lymphocytes, dendritic cells, macrophages). The beta chain is approximately 26-28 kDa and its gene contains 6 exons. Exon one encodes the leader peptide, exons 2 and 3 encode the two extracellular domains, exon 4 encodes the transmembrane domain and exon 5 encodes the cytoplasmic tail. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:32934629-32941070 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.32 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
MHC class II antigen presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Antigen processing and presentation pathway
Type I diabetes mellitus pathway
Allograft rejection pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Systemic lupus erythematosus pathway
Graft-versus-host disease pathway
Asthma pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
Viral myocarditis pathway
Leishmaniasis pathway
Staphylococcus aureus infection pathway
Toxoplasmosis pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.351279 Hs.601376 Hs.614506 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002118 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4760 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 00831 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||