Homo sapiens Gene: CAPNS1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-46584.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | CAPNS1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | calpain, small subunit 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | 30K; CALPAIN4; CANP; CANPS; CAPN4; CDPS; CSS1 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000126247 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
calpain, small subunit 1
calpain, small subunit 1
calpain, small subunit 1
calpain, small subunit 1
calpain, small subunit 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
Calpains are a ubiquitous, well-conserved family of calcium-dependent, cysteine proteases. Calpain families have been implicated in neurodegenerative processes, as their activation can be triggered by calcium influx and oxidative stress. Calpain I and II are heterodimeric with distinct large subunits associated with common small subunits, all of which are encoded by different genes. This gene encodes a small subunit common to both calpain I and II and is associated with myotonic dystrophy. Two transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:36139575-36150353 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q13.12 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 64 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.515371 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001003962 NM_001749 XM_005259295 XM_005259296 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12489 | ||||||||||||||||||
HPRD | 00240 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||