Homo sapiens Gene: CASC3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-47220.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CASC3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cancer susceptibility candidate 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BTZ; MLN51 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000108349 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cancer susceptibility candidate 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The product of this gene is a core component of the exon junction complex (EJC), a protein complex that is deposited on spliced mRNAs at exon-exon junctions and functions in nonsense-mediated mRNA decay (NMD). The encoded protein binds RNA and interacts with two other EJC core components. It is predominantly located in the cytoplasm, but shuttles into the nucleus where it localizes to nuclear speckles. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:40140318-40172183 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA transport pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.743287 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007359 XM_005257163 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11362 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16225 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||