Homo sapiens Gene: SOCS6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4847.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SOCS6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | suppressor of cytokine signaling 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CIS-4; CIS4; HSPC060; SOCS-4; SOCS-6; SOCS4; SSI4; STAI4; STATI4 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000170677 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
suppressor of cytokine signaling 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
SOCS6 associates with KIT and regulates KIT receptor signalling and leads to MAPK activation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene contains a SH2 domain and a CIS homolog domain. The protein thus belongs to the cytokine-induced STAT inhibitor (CIS), also known as suppressor of cytokine signaling (SOCS) or STAT-induced STAT inhibitor (SSI), protein family. CIS family members are known to be cytokine-inducible negative regulators of cytokine signaling. The expression of this gene can be induced by GM-CSF and EPO in hematopoietic cells. A high expression level of this gene was found in factor-independent chronic myelogenous leukemia (CML) and erythroleukemia (HEL) cell lines. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:70288901-70330200 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 36 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
KitReceptor pathway
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REACTOME |
Regulation of KIT signaling pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH |
JAK STAT pathway and regulation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.44439 Hs.603129 Hs.623364 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004232 XM_005266783 XM_006722577 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11998 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05491 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||