Homo sapiens Gene: NR1H4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-52872.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NR1H4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BAR; FXR; HRR-1; HRR1; RIP14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000012504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
NR1H4 is an essential component of a network of nuclear receptors that regulate intestinal innate immunity and homeostasis.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] The bile acid sensor Nr1h4 (FXR) Is required for immune-regulatory activities of TLR9 in intestinal inflammation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a ligand-activated transcription factor, which shares structural features in common with nuclear hormone receptor family, such as a DNA-binding domain that targets the receptor to specific DNA sequences, and a ligand-binding domain, which interacts directly with the ligand and contains a ligand-dependent transcriptional activation domain. This protein functions as a receptor for bile acids, and when bound to bile acids, regulates the expression of genes involved in bile acid synthesis and transport. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:100473708-100564413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol pathway
Synthesis of bile acids and bile salts pathway
Recycling of bile acids and salts pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Endogenous sterols pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
Cytochrome P450 - arranged by substrate type pathway
Orphan transporters pathway
Metabolism pathway
Biological oxidations pathway
Phase 1 - Functionalization of compounds pathway
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KEGG |
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
RXR and RAR heterodimerization with other nuclear receptor
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.733865 Hs.734504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001206977 NM_001206978 NM_001206979 NM_001206992 NM_001206993 NM_005123 XM_006719719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS55873 CCDS55874 CCDS55875 CCDS55876 CCDS9078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||