Homo sapiens Gene: LRR1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-5682.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | LRR1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | leucine rich repeat protein 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000165501 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
leucine rich repeat protein 1
leucine rich repeat protein 1
leucine rich repeat protein 1
leucine rich repeat protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene contains a leucine-rich repeat (LRR). It specifically interacts with TNFRSF9/4-1BB, a member of the tumor necrosis factor receptor (TNFR) superfamily. Overexpression of this gene suppresses the activation of NF-kappa B induced by TNFRSF9 or TNF receptor-associated factor 2 (TRAF2), which suggests that this protein is a negative regulator of TNFRSF9-mediated signaling cascades. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Feb 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:49598697-49614672 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 26 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.451090 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_152329 NM_203467 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9686 CCDS9687 | ||||||||||||||||||
HPRD | 15164 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||