Homo sapiens Gene: SYMPK | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-58156.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SYMPK | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | symplekin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | SPK; SYM | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000125755 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
symplekin
symplekin
symplekin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein that functions in the regulation of polyadenylation and promotes gene expression. The protein forms a high-molecular weight complex with components of the polyadenylation machinery. It is thought to serve as a scaffold for recruiting regulatory factors to the polyadenylation complex. It also participates in 3'-end maturation of histone mRNAs, which do not undergo polyadenylation. The protein also localizes to the cytoplasmic plaques of tight junctions in some cell types. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a nuclear protein that functions in the regulation of polyadenylation and promotes gene expression. The protein forms a high-molecular weight complex with components of the polyadenylation machinery. It is thought to serve as a scaffold for recruiting regulatory factors to the polyadenylation complex. It also participates in 3\'-end maturation of histone mRNAs, which do not undergo polyadenylation. The protein also localizes to the cytoplasmic plaques of tight junctions in some cell types. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:45815410-45863290 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.32 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 41 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Tight junction pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.515475 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004819 XM_005259286 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12676 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09090 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||