Version 5.4
| Homo sapiens Gene: TRIM42 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-58977.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | TRIM42 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | tripartite motif containing 42 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000155890 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
tripartite motif containing 42
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
| Summary |
TRIM42 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, namely a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 3:140678039-140701150 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | q23 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q8IWZ5 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 287015 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.343487 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_152616 XM_006713608 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:19014 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS3113 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC026324 AF521868 AK097416 AL833848 BC130472 CH471052 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAI30473 AAO14945 BAC05042 CAD38707 EAW79015 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 287015 | ||||||||||||||||||