Homo sapiens Gene: PDLIM7 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-60188.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDLIM7 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PDZ and LIM domain 7 (enigma) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | LMP1; LMP3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000196923 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
PDZ and LIM domain 7 (enigma)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is representative of a family of proteins composed of conserved PDZ and LIM domains. LIM domains are proposed to function in protein-protein recognition in a variety of contexts including gene transcription and development and in cytoskeletal interaction. The LIM domains of this protein bind to protein kinases, whereas the PDZ domain binds to actin filaments. The gene product is involved in the assembly of an actin filament-associated complex essential for transmission of ret/ptc2 mitogenic signaling. The biological function is likely to be that of an adapter, with the PDZ domain localizing the LIM-binding proteins to actin filaments of both skeletal muscle and nonmuscle tissues. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:177483394-177497606 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q35.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 60 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events regulated by Ret tyrosine kinase
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_005451 NM_203352 NM_213636 XM_006714937 XM_006714940 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4422 CCDS4423 CCDS4424 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10436 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||