Homo sapiens Gene: CLRN1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-61320.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLRN1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | clarin 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | RP61; USH3; USH3A | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000163646 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
clarin 1
clarin 1
clarin 1
clarin 1
clarin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that contains a cytosolic N-terminus, multiple helical transmembrane domains, and an endoplasmic reticulum membrane retention signal, TKGH, in the C-terminus. The encoded protein may be important in development and homeostasis of the inner ear and retina. Mutations within this gene have been associated with Usher syndrome type IIIa. Multiple transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:150926163-150972999 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q25.1 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001195794 NM_052995 NM_174878 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3153 CCDS35492 CCDS56285 | ||||||||||||||||||
HPRD | 05905 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||