Bos taurus Gene: SYNGAP1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-629070.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SYNGAP1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ras GTPase-activating protein SynGAP | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000020975 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
synaptic Ras GTPase activating protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000197283:
The protein encoded by this gene is a major component of the postsynaptic density (PSD), a group of proteins found associated with NMDA receptors at synapses. The encoded protein is phosphorylated by calmodulin-dependent protein kinase II and dephosphorylated by NMDA receptor activation. Defects in this gene are a cause of mental retardation autosomal dominant type 5 (MRD5). [provided by RefSeq, Dec 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 23:7537952-7566784 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of Ras family activation
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MBI8 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 790307 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.65817 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205466 XM_005223272 XM_005223273 XM_005223274 XM_005223275 XM_005223276 XM_005223277 XM_005223278 XM_005223279 XM_005223280 XM_005223281 XM_005223282 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11497 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02054900 DAAA02054901 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 790307 | ||||||||||||||||||||||||||