Bos taurus Gene: SLC1A3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-630261.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC1A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Excitatory amino acid transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000018245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Excitatory amino acid transporter 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000079215:
This gene encodes a member of a member of a high affinity glutamate transporter family. Mutations in this gene are associated with episodic ataxia, Type 6. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Nov 2009] This gene encodes a member of a member of a high affinity glutamate transporter family. This gene functions in the termination of excitatory neurotransmission in central nervous system. Mutations are associated with episodic ataxia, Type 6. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:37596604-37679976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Neurotransmitter uptake and Metabolism In Glial Cells pathway
Neuronal System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Neurotransmitter uptake and Metabolism In Glial Cells pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism pathway
Neurotransmitter uptake and Metabolism In Glial Cells pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||