Homo sapiens Gene: SLC1A3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16618.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC1A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | EA6; EAAT1; GLAST; GLAST1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000079215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of a member of a high affinity glutamate transporter family. Mutations in this gene are associated with episodic ataxia, Type 6. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Nov 2009] This gene encodes a member of a member of a high affinity glutamate transporter family. This gene functions in the termination of excitatory neurotransmission in central nervous system. Mutations are associated with episodic ataxia, Type 6. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:36606355-36688334 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Neurotransmitter uptake and Metabolism In Glial Cells pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.481918 Hs.592840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001166695 NM_001289939 NM_001289940 NM_004172 XM_005248342 XM_006714488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3919 CCDS54844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||