Bos taurus Gene: APOA4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-630787.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | APOA4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | apolipoprotein A-IV precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000019770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
apolipoprotein A-IV precursor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000110244:
Apoliprotein (apo) A-IV gene contains 3 exons separated by two introns. A sequence polymorphism has been identified in the 3'UTR of the third exon. The primary translation product is a 396-residue preprotein which after proteolytic processing is secreted its primary site of synthesis, the intestine, in association with chylomicron particles. Although its precise function is not known, apo A-IV is a potent activator of lecithin-cholesterol acyltransferase in vitro. [provided by RefSeq, Jul 2008] Apoliprotein (apo) A-IV gene contains 3 exons separated by two introns. A sequence polymorphism has been identified in the 3\'UTR of the third exon. The primary translation product is a 396-residue preprotein which after proteolytic processing is secreted its primary site of synthesis, the intestine, in association with chylomicron particles. Although its precise function is not known, apo A-IV is a potent activator of lecithin-cholesterol acyltransferase in vitro. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:27906599-27909370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Retinoid metabolism and transport pathway
Chylomicron-mediated lipid transport pathway
Amyloids pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Visual phototransduction pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Metabolism pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
Disease pathway
Disease pathway
Retinoid metabolism and transport pathway
Amyloids pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
Chylomicron-mediated lipid transport pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Visual phototransduction pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
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KEGG |
Fat digestion and absorption pathway
Fat digestion and absorption pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1N3Q7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 537301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.15890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001037480 XM_005215852 XM_005215853 XM_005215854 XM_005215855 XM_005215856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02040389 GJ062397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | DAA22387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 537301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||